手術室凈化工程就其控制對象來說，共分兩種，一種為工業潔凈室，另一種為生物潔凈室。工業潔凈室室以控制非生物微粒的污染為主要任務，而生物潔凈室，則以控制生物微粒的污染為主要任務。但是，非生物微粒還是生物微粒，在空氣凈化技術領域都被看做微粒，都具有微粒的屬性，這在凈化領域中是需要避免的，而手術室凈化工程對這類微粒控制的途徑主要體現在以下幾個方面。

    1.有效的阻止室外的污染侵入室內，這是手術室凈化工控制污染的最主要途徑，主要涉及空氣凈化處理的方法、室內的壓力等。

    2.迅速有效地排除室內應經發生的污染，這主要涉及室內的氣流組織，也是體現潔凈室功能的關鍵。

    3.控制污染源，減少污染發生量，這主要涉及發生污染的設備的設置與管理和進入潔凈室的人與物的凈化。前者多屬于工藝問題。

    手術室凈化工程是有著嚴格的保證和要求，主要有以下幾點:

    （1）進入手術室必須更換洗手衣褲、鞋帽。

    （2）嚴格控制入室人數。

    （3）盡量減少手術室的開門次數與時間（更不可將門打開不關），維持"相對密閉狀態"，以防外來污染的進入。

    （4）手術前用酒精擦拭室內物品、醫療程儀器、設備等。

    （5）術后及時、徹底清潔室內所有物品、墻壁及地面。

    （6）婦女女員工不可用粉、頭發噴霧劑和指甲油之類的化妝品，以減少污染來源。

    （7）工作服應選用不易產生靜電、不易脫落纖維的滌綸和尼龍織物。

    （8）定期檢測層流系統功能狀態，測試手術室環境空氣潔凈度指標和細菌培養等。總之，使用手術室凈化工程，強化無菌觀念和正規化管理仍然是醫療程安全的根本保證與要求，仍然是層流凈化手術室工作之根本、之重點，只有當兩者緊密結合起來才是趨于完美的。