實施手術室凈化工程，最重要的便是利用凈化技術與設備，控制室內的有害污染物，避免細菌等通過空氣途徑傳播到曝露在外的體腔中，引發手術創口感染。凈化手術室內主要控制的是微生物、病菌等活的粒子。

　　手術室凈化工程的造價十分昂貴，可謂是“寸土寸金”。因此，應在節省資金的前提下，通過設計來開發凈化手術區，盡量提高手術區利用率，減少不必要的浪費。手術室凈化工程的建設應考慮到手術部使用合理的方便性、舒適美觀性和實際運用需求相結合的特點。

　　為了避免室外非潔凈空氣污染手術室凈化工程環境，室內應保持正壓。但是，在手術室門開啟的時候，室內正壓差會迅速下降。手術室凈化工程中，應使手術室的氣密電動門與手術室內排風機實行門機聯控，當手術門開啟時，自行關閉排風機，當手術門關閉時，才能啟動運行排風機。

　　手術室凈化工程應考慮到建設方的需求，站在建設方的角度去設計、施工。凈化工程造價不低，因此要對各手術室面積進行適當調整，分別設置適應醫院專項需求的超大型、特大型、大中小型手術室，以保證各種不同手術的需要。

　　維護工作在保證手術室凈化工程質量的過程中同樣有著舉足輕重的作用。凈化空調機組的維護與保養是否到位，直接影響到空調是否能正常使用，也就直接關系到手術室的凈化級別與溫度、濕度是否達標。在手術間內空調溫度與濕度不能控制在適宜范圍內時，應及時通知維保人員，對凈化工程空調系統進行檢查，找出問題及時處理。以保證手術室的正常運行。